主要是和阴道壁囊肿穿孔感染及盆腔肿物相鉴别。流脓的阴道壁囊肿和Ⅱ型斜隔局部症状相同,但通过B超检查泌尿系肾脏情况不难鉴别。卵巢肿物也会嵌顿在盆腔底部,但不同与斜隔引起的肿物那样和阴道壁连成一体并可造成阴道移位变形。
2.子宫内膜异位症 多见于Ⅰ型患者,经血倒流引起子宫内膜异位症。