本病主要表现为部分干骺端软骨不能经历正常的软骨化骨而停滞于软骨阶段，并沉积在干骺端或逐渐转移至骨干继续发育形成畸形。因此，该病最多见于青少年手足短管状骨，其次为四肢长骨，但累及肩胛骨、胸骨者十分少见。其畸形随青春发育而发展，一般到达成年后肿瘤即停止生长，少数病例可恶变为软骨肉瘤。大多数患者表现为单侧不对称性发病，伴内翻或外翻畸形。桡骨长，弯曲，造成桡骨头脱位。手指软骨瘤可以生长得很大，很多，以致使手的功能完全丧失。合并肢体畸形者称为Ollier′s 病，合并皮肤、内脏血管瘤者称为Maffucci′s综合征。
