病毒感染
轮状病毒进入体内后能否致病取决于感染病毒的数量，入侵病毒量多，有助于病毒侵入，轮状病毒进入体内后通过两个途径引起腹泻：一是轮状病毒直接对小肠绒毛上皮细胞损害，引发病理改变；二是轮状病毒在复制过程中的代谢产物作用于小肠内皮细胞，破坏了肠内细胞的正常生理功能引起腹泻。少量的病毒会被人体自身免疫掉，不会发病。
生理因素
机体自身的生理性特征可以导致该病的发生，机体肠上皮刷状缘的乳糖酶（为轮状病毒受体）含量较多时，如在婴儿时期，则容易感染轮状病毒。随年龄增长，此酶量减少，易感性下降。
免疫力低下
各种原因导致免疫力下降时，有助于轮状病毒侵入，诱发疾病。
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