很多疾病可以出现与腕管综合征相似的症状，如手指麻木，疼痛等，因此，应注意鉴别，防止误诊。
1、鉴别诊断中最主要的要与末梢神经炎和神经根型颈椎病相鉴别。
末梢神经炎以手指麻木为主，疼痛较轻，多为双手，呈对称性感觉障碍，鉴别时困难不大。
2、神经根型颈椎病与腕管综合征的鉴别很重要，二者均可有手指麻木，疼痛，但治疗完全不同，同时，二者有可能同时存在，即同一个病人同时患颈椎病及腕管综合征，需要仔细区分，分别治疗才能取得良好疗效。
神经根型颈椎病的特点是疼痛呈放射性，从颈部，肩部向远端放射，患者同时有颈部，肩部，上肢及手的症状，疼痛与颈部活动有一定关系，颈椎X线片及CT可显示颈椎退行性变，相应神经根孑L狭窄，疼痛及感觉障碍范围广，肌电图可提供鉴别诊断依据，腕管综合征表现为夜间手指疼痛，压指试验阳性，肌电图检查从近侧腕横纹到大鱼际的正中神经传导速度延长。
3、另外，还必须与周围神经炎，糖尿病性末梢神经炎，风湿性关节炎及类风湿关节炎，甲状腺功能减退，痛风等相鉴别。
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