除根据有以上致病因素外，出现肺部感染症 状体征或在真菌流行地区出现肺部感染，经抗细菌治疗无效者，应考虑该病的可能，诊断主要依据病原学检查，其中痰，尿，粪便，分泌物，胸腔积液，血液，脑积 液，脓液等的涂片，培养，组织检查找到真菌孢子及(或)菌丝是诊断的重要依据，结合临床资料可作出诊断，另外真菌抗原皮肤试验，血清学检查，动物接种等可 协助诊断，组织学检查见到典型的菌丝及真菌培养阳性，真菌培养基的真菌产出率，比标准的细菌培养基高。肺部真菌病的临床及X线表现多无特异性，易与肺部常见疾病如肺结核、肺炎、寄生虫病、肺肿瘤、慢性支气管炎等混淆。气道侵袭性曲霉菌病没有特异性，类似于细菌性、支原体性、病毒性支气管炎或支气管肺炎，应予鉴别。
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