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　　与金黄色葡萄球菌、肠杆菌、肺炎克雷白杆菌等感染相鉴别。

　　金黄色葡萄球菌感染：金黄色葡萄球菌是人类化脓感染中最常见的病原菌，可引起局部化脓感染，也可引起肺炎、伪膜性肠炎、心包炎等，甚至败血症、脓毒症等全身感染。

　　肠杆菌感染：包括一大群生物性状相似的革兰阴性无芽胞杆菌，其中部分为致病菌，如：沙门菌属、志贺菌属等;而多数为肠道正常菌群，在一定条件下可以致病，故称为条件致病菌。

　　肺炎克雷白杆菌感染：　肺炎克雷白杆菌是重要的医院内感染病原菌据报道，肺炎克雷白杆菌在临床标本中分离的革兰阴性杆菌中占第二位，仅次于铜绿假单胞菌;痰标本中最多，尿次之。

　　菌体鉴别：培养阳性，并经生化鉴定为假单胞菌可以确诊可在选择培养基上并产生绿脓色素的即可鉴定为铜绿假单胞菌，若无色素或在鉴别培养基上不发酵乳糖或葡萄糖的革兰阴性杆菌，可色素鉴定进一步鉴别。

　　绿脓杆菌和其他假单胞菌的主要鉴别是葡萄糖氧化分解、氧化酶、精氨酸双水解、乙酰胺酶、葡萄糖酸氧化、硝酸盐还原产氨试验均为阳性绿脓杆菌败血症患者尿中出现铜绿色蛋白尿，将患者尿液调成酸性、碱性和中性，置于暗室分别用紫外线照射，如有铜绿蛋白尿则发生淡绿色荧光。