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       根据病史,临床表现,染色或培养真菌阳性,典型病例不难诊断,培养或活检出致病性真菌,可明确诊断,由于真菌培养需时较长,而真菌性巩膜炎的视力预后,又决定于治疗开始的早晚,只要刮片发现真菌菌体或菌丝,即可诊断为真菌性巩膜炎,并立刻进行抗真菌治疗,如果具备条件,应进行抗真菌药物敏感试验。
  应与细菌性或病毒性巩膜炎相鉴别,真菌性巩膜炎一般眼部刺激症状轻微,但病程绵长,药物治疗效果差,鉴别尚需要实验室检查的阳性结果。

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