本病应与扁平苔藓、白色海绵状痣、先天性角化不良症、先天性厚甲症等相鉴别。
1.口腔扁平苔藓 白斑多见于上下唇及颊部齿咬合部，常呈网状或花纹状排列，周围可有散在性的紫红色多角形丘疹，而黏膜白斑病则缺如，此外，身体处常见有扁平苔藓皮损。组织学上上皮细胞无不典型增生，基底细胞液化变性，真皮上部有以淋巴细胞为主的致密带状浸润。
2.黏膜白色海绵痣 是一种遗传性疾病，较罕见。好发于婴儿，少数发生于青春期，至青春期达于极点。病变累及整个口腔黏膜，白色或灰白色损害，呈海绵状。如发生于40岁以下的患者，病变仅局限于部分口腔黏膜。
3.梅毒性黏膜白斑 色乳白，周围有暗红色浸润，白斑表面浆液涂片可查见梅毒螺旋体。身体他处可有其他梅毒症状，梅毒血清反应阳性。
4.白色念珠菌病 多发生于儿童。白膜周围有炎症，取白膜涂片镜检可发现假菌丝及孢子。
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