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    1.沙眼衣原体性尿道炎需要与淋球菌、其他病原体引起的尿道炎等鉴别。
  2.沙眼衣原体性附睾炎 需要与淋球菌、大肠埃希菌、铜绿假单胞菌等引起的附睾炎和睾丸扭转等鉴别。
  3.沙眼衣原体性直肠炎需要与淋球菌、肠道细菌(志贺菌、沙门菌等)、原虫(蓝氏贾第虫、溶组织阿米巴、隐孢子虫)、病毒(巨细胞病毒、腺病毒)等引起的直肠炎鉴别。
  4.沙眼衣原体子宫颈炎需要与淋球菌性子宫颈炎鉴别。
  5.新生儿沙眼衣原体性结膜炎需要与淋球菌、大肠埃
  希菌、金黄色葡萄球菌、化脓性链球菌引起的结膜炎鉴别。
  6.新生儿沙眼衣原体性肺炎需要与病毒(呼吸道合胞
  病毒、巨细胞病毒、腺病毒和流感病毒)、细菌(链球菌、金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、流感杆菌、肺炎球菌)等引起的肺炎鉴别。

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