体外实验发现，妨碍细胞壁合成的β内酰胺类药物、万古霉素和杆菌肽对MH无效，抑制蛋白合成的氨基甙类药物、氯霉素和利福平对支原体有中等疗效。MH、UU对四环素敏感，MH偶见耐四环素但对林可霉素敏感。临床上常用药物有：
1.四环素类 四环素0.5g，4次/d，口服，治疗共7天，再改为0.25g，4次/d，口服2周。或盐酸多西环素(强力霉素)0.1g或米诺环素(二甲胺四环素)0.1g，2次/d，口服2周。
2.其他抗生素 对以上药物不能耐受或疗效不佳者，可用红霉素0.5g，4次/d，共服7天。或阿奇霉素(azithromycin)1g，一次口服。亦可应用氧氟沙星(氟嗪酸)0.2g 2次/d，共服7～14天。
3.配偶接受相应治疗 疗程结束1周后重复检查，治愈标准是症状消失，无尿道分泌物，尿沉渣涂片白细胞数正常(<5个/高倍视野)。
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