1994年现南京医科大学眼科医院名誉院长袁南荣教授和院长蒋沁教授在省卫生厅、南京医科大学以及外国友人的关心下筹建了江苏省第一个国际合作性眼科专科医院——中日友好南京眼科医院。当时医院在江苏省率先引进准分子激光治疗近视眼技术，开展PRK、LASIK等屈光手术。 2004年10月，在原中日友好南京眼科医院的基础上，南京医科大学眼科医院孕育而生，屈光手术中心随即成立。 本着为安全有效治疗广大屈光不正患者的目的，我院屈光手术中心始终坚持术前检查严格、诊疗设备先进、手术医生亲诊亲治、术后护理规范的四大原则。

    目前我院屈光手术中心有教授（主任医师）1名、副教授（副主任医师）3名，医师3名、护理人员5名，所有人员均持有卫生部颁发的准分子激光近视治疗上岗证，手术医生均有十多年的手术经验，亲自为患者进行术前检查、设计手术方案和手术。中心配备德国ESIRIS公司生产的KERATRON SCOUT角膜地形图仪及角膜像差分析系统、Esiris（爱丽丝）智能高速扫描准分子激光系统、法国Moria公司生产的M2双马达板层刀、日本 “HOYO”（豪雅）ACP-300型及NIDEK公司RT-600型综合验光仪、TOMEY公司的角膜测厚仪等先进诊疗设备，除开展LASIK、LASEK、PRK等常规角膜屈光手术项目外，还开展目前国内唯一的角膜波前像差引导的个体化切削手术ORK和眼内屈光手术、前房人工晶体植入、虹膜夹型人工晶体植入、后房型人工晶体植入、透明晶体摘除加人工晶体植入术等。 安全、有效、持久是我院屈光手术中心的宗旨，十多年、数万例成功手术的经验积累，不断对先进技术和设备的引进、严格的管理和规范的操作流程将使我院屈光手术中心成为省内外广大屈光不正患者首选的治疗中心。