是从事慢性非传染性疾病、口腔疾病和伤害预防控制专业科室，下设防治办公室、口腔门诊。慢病防制科的任务是建立健全适应南山区区社会和经济发展、满足居民健康需求的慢性病防制体系，积极推行以健康促进策略为依据、公共卫生措施为主导、社区综合防制为平台的慢性病预防控制战略，降低人群危险因素水平，遏制慢性病发病率和死亡率的上升趋势，减少早卒，提高生命质量，延长健康期望寿命，达到控制慢性病的总体目标。开展重点人群高血压、糖尿病、肿瘤和心脑血管等慢性病的综合防制工作，开展恶性肿瘤、脑卒中等疾病及伤害的常规监测；开展学生口腔疾病的监测调查，指导和实施学生口腔疾病病的防治。负责制定、实施和评估南山区慢性非传染性疾病预防和控制计划和实施方案，建立和完善区内慢性非传染性疾病的监测评价系统，为慢性病防制工作提供科学依据。负责区内外慢性非传染性疾病、口腔病和伤害防制相关信息的搜集、分析，上报、反馈，为区卫生行政部门提供慢性非传染性疾病、口腔疾病病和伤害预防控制的政策咨询。负责全区慢性非传染性疾病防制的业务指导、管理和技术保障，为全区基层医疗单位专业人员提供慢性非传染性疾病、口腔疾病和伤害预防控制的业务指导与培训，组织开展慢性非传染性疾病、口腔疾病病和伤害预防控制的应用性研究、技术攻关和技术合作。