普通外科开展胰十二指肠切除术、巨大肝癌半肝切除术、肝叶切除胆肠吻合结合内窥镜弹道碎石、液电碎石治疗复杂肝胆管结石，全胃及联合脏器切除的胃癌根治术、结直肠癌的根治及保肛术、各种甲状腺良、恶性肿瘤和甲亢的双侧甲状腺次全切除、各种腹股沟疝的传统和无张力修补术等；近年，外二科已逐步走向了以腹腔镜及内窥镜为代表的微创外科时代，开展了腹腔镜下胆囊切除、肝囊肿开窗、肝脓肿引流、阑尾切除、肠粘连松解、疝修补及疝囊高位结扎、先天性巨结肠根治及腹腔镜结直肠癌根治术、重症胰腺炎胰包膜切开引流术, 微创保胆术等微创手术。同时还将内窥镜与传统手术有机结合，开展了十二指肠镜逆行胰胆管造影（ERCP）及乳头切开（EST）取石、鼻胆管引流及胆道内支架置入术。另外，外二科开展了电子胃镜、电子肠镜下的息肉套扎、电切除术，消化道出血的内镜下施夹止血等内窥镜手术，充实了微创外科的内容。
