药学部是集药品供应管理、制剂生产及临床药学研究为一体的药学技术职能部门，下设调剂科、制剂科、药库管理科、药品检验科、临床药学与药学研究科等5个二级科室。全部员工100多人，现有主管药师以上职称29人，其中主任药师2人，副主任药师6人。实现从传统的药品供应管理单模式向现代化的药品管理，临床药学，药学监护，药学信息，人才培养多元化模式的转变，处于海南省医院药学学科领先水平。

　　药学部将药库和门诊中西药房组成网络系统，实现药品查询、计划领用、划价、统计、用药分析、工作量统计等计算机化，实行划价收费一条龙管理，在全国率先开发运行英特网上药品招标采购，对临床应用药品的供应管理全面实行了计算机网络化。

　　药学部建立起以合理用药为中心的临床药学服务体系。1992年建立临床药学实验室，开展了地高辛、大伦丁、环孢霉素A、茶碱、丙戊酸、庆大霉素、甲氨蝶呤等治疗药物的血药浓度监测，充分利用监测数据及观察病人用药后的实际情况制定个体化给药方案，减少药物的毒副作用，使临床用药更准确更安全。还承担省药品监督管理局批准的新药人体相对生物利用度及生物等效性的实验研究工作。并建立了药品不良反应监测机构，按规定上报药物不良反应报告。

　　药学部负责全院药品质量监督和自制制剂的质量检验；定期或不定期对全院药品进行全面检查或抽查，杜绝假药、劣药、无证药品，及时报废变质、过期药品。对制剂生产的全过程实行全面质量监控，保证不合格的原辅料不投入生产，不合格的半成品不流入下一工序，不合格的成品不应用于临床。

　　药学部按GPP标准设计建造3000平方米，总造价1500万元的现代化的制剂大楼，配有完善的空气净化装置和中央空调系统，以及国际上先进的软包装大输液生产线、口服液生产线、外用药生产线、药品质量检验室、制剂研究室等，严格按规定报批，按要求进行配制与质控，达到国内先进水平，在省内处于领先地位。