骨与软组织肿瘤科建于2003年，是甘肃省肿瘤专科医院中较早成立的骨与软组织肿瘤专业之一。现有床位25张，拥有副主任医师1人，主治医师2人，住院医师4人，其中硕士研究生3人，在读研究生2人，护理人员10人。该科主要治疗病种以面膜与软组织的良恶性肿瘤以及骨的转移癌。对于骨干软组织恶性肿瘤强调以综合治疗为主的保肢治疗是该科的的特色，尤其是在以专科医院的依托下，肿瘤综合治疗是专长。在骨与软组织肿瘤中，骨转移癌治疗方面积累了丰富治疗经验。肢体恶性肿瘤采用综合治疗，新辅助化疗，即术前会身化疗、手术、术后化疗。根据局部病灶情况分别采用瘤段骨灭活再植、人工假体置换术、异体骨植骨、不离体无水乙醉灭活等方法，使90%以上的肢体恶性骨肿瘤患者获得保肢。骨与软组织肉瘤采用广泛切除，尤其对复发、难治性骨与软组织肉瘤采取广泛切除、肌腱移位、各种游离和带蒂皮瓣等方法修复术后软组织缺损。组织间粒子植入的方法治疗累及主要神经血管束的软组织肉瘤，取得较好的局部控制率，降低了截肢率。对骨转移性肿瘤根据不同的部位采用综合治疗，减轻癌痛，延长患者生命，提高生存质量。 同时开展椎体及椎管内肿瘤切除术；四肢、脊柱骨折的手术治疗；脊柱结核的药物及手术治疗；脊柱及椎间盘退变性疾病的内镜下治疗；膝关节镜下检查治疗术；人工髋、膝关节置换术；脊髓损伤的早期药物治疗；充分减压，有效固定治疗；颈、腰椎间盘突出的臭氧髓核消融术。