外三科成立于2009年6月，业务范围包括脑外科、泌尿男性外科，是巴东县最早成立的颅脑和泌尿男性专科，现有医护人员17人，其中主任医师1人，副主任医师2人，主治医师1人，临床住院医师3人，科室现开放床位45张，承担了本地区及部分周边县市的医疗和教学任务。
其中脑外科为我县特色专科，能常规开展脑外科临床中各种常见疾病的手术治疗以及部分通常为省级医院才能开展的高难度手术，如：颅脑外伤、颅内肿瘤、脑血管疾病和功能神经外科的各种神经外科手术治疗。而且在颅脑外伤方面已建立了一整套规范化的颅脑外伤救治体系，明显提高了治愈率。
