厦门市呼吸疾病诊治中心是我市重点学科，为我省强势医疗品牌，在省内具有较高知名度。中心拥有4名主任医师和3名副主任医师（其中有3人分别在意大利、美国、日本进行过一年以上的专业研修），有完整的专业人才梯队。中心拥有全国唯一一台气道超声设备，并拥有电子支气管镜及多条纤维支气管镜、德国耶格肺功能仪、气道冷激发试验等先进设备。
设有床位110张，分设四个病区：呼吸系统肿瘤病区、肺结核病区、老年呼吸病区、胸外科病区，设立了呼吸疾病微生物实验室、呼吸疾病分子生物实验室、呼吸检测室等。中心在分子生物学方面开展了分子杂交、DNA探针检测、SOUTH转移等研究，在免疫学方面开展了酶联免疫学检查，开展了镜内外X线定位肺小结节针吸活检、气管支架置放术等技术，其中，在分子杂交、SOUTH转移等生物学、免疫学的实验室研究上已走在全省前列。 中心擅长于肺部疑难疾病的鉴别诊断，尤其在多耐药性肺结核、肺癌、老年性肺部疾患等的诊治上有较高造诣。
