1、婚前保健：南山妇幼保健院作为南山区唯一一家政府指定婚前医学检查单位，承担了全区婚前医学检查，为准备结婚的准夫妇提供婚前卫生指导、婚前保健和优生优育、遗传咨询，并为南山区户籍准夫妇（一方即可）提供免费婚前卫生指导、婚前保健和优生优育、遗传咨询。
2、妇女病普查普治：为全区妇女提供优质的妇科疾病普查服务，并对幼教机构提供妇女健康检查，针对普查发现的各种妇科疾病给予积极的治疗。
3、青春期保健：开展青春期性卫生知识咨询、少女月经期保健、少女避孕、妊娠等问题的咨询和指导服务。
4、围绝经期和老年妇女保健：开展围绝经期内分泌紊乱、老年妇女骨质疏松防治，性激素替代治疗规范化管理和指导、生殖系统肿瘤预防等。为围绝经期和老年妇女提高生活质量提供全方位的保健服务。
5、乳腺保健：拥有先进的乳腺彩超检查手段，及早发现、治疗乳腺小叶增生，积极预防乳腺癌的发生。
