成立于1974年，是全市最早开展病理诊断与研究的科室，现有医技人员5名，其中副主任医师2名，主治医师1名，临床医师1名，技师1名。
拥有设备：病理图文报告系统、欧林巴斯BX－41三目显微镜、徕卡BM2025切片机、自动脱水机、组织包埋机、超声波体快速处理仪、烤片机、超低温冰柜等。年开展组织病理学检查2000余例，细胞学检查500余例。在常规病理学诊断的基础上，开展了快速病理诊断及术中病理诊断，并承担了国家“七五”、“八五”、“九五”、“十五”食管癌攻关课题的病理相关任务。经过长期的实践和发展，在病理学诊断，尤其是上消化道肿瘤的病理诊断及早期癌、癌前病变的诊断方面积累了丰富的经验，曾发表国家级论文60余篇。
