1981年，医院设立痔瘘科，1990年改称肛肠科。主要治疗各类肛瘘、肛裂、脱肛、内痔、外痔、混合痔、直肠息肉、直肠肿瘤等疾病。肛肠科位于门诊部一楼西侧，现有副主任医师2人、主治医师3人、医师2人、护士3人。
2000年以来，先后采取中医及中西医结合、硬化剂注射等方法对各种痔疮、复杂性肛瘘、肛周脓肿等有独到的治疗方法，对肛周脓肿采取一次性根治术，对复杂性肛瘘采取高位挂线、低位切开缝合及旷置术，病程短、痛苦小，对长期便秘的患者采取中西医结合及灌肠疗法，起到了很好的治疗效果。对混合痔采取内外分别处理及齿线保留术，有对痔疮的远期疗效好及复发低等特点。
2001年以来，科室先后引进高频电刀及新一代激光对上述病症起到了一定的治疗效果，为患者解除了痛苦。
2006年，采用目前国内治疗痔疮及直肠粘膜脱垂的最新技术(PPH手术)。具有不切除肛垫，最大程度保留了肛门的功能，避免了肛门狭窄、肛门失禁等并发症，对肛周皮肤无损伤，术后无疼痛，因而免除了术后换药，病人住院时间短、创面恢复快。
