航天中心医院输血科是北京市成立较早的独立的输血医技科室，经过多年的发展，已形成设备、技术先进、功能齐全的试验性和治疗性综合科室。拥有各型离心机、卡式交叉配血、卡式血型系统鉴定工作站、专用储血冰箱、血小板保存箱等设备。设置有血清学试验室、储血室、发血室、自体采血室、血液治疗室等。
现有医技人员6名，其中，主管技师2名，技师2名，技士1名，主管护师1人。输血安全是输血科永恒的工作主题，为保证病人输血安全，减少血源性传播疾病和不良反应的发生，输血科大力推广科学合理的输血方式：成分输血和自身输血。成分输血率在2000年就达到100%。为使病人在航天中心医院接受最好的输血治疗，输血科开展了各项技术，如血制品白细胞滤除术、自体输血技术、血液辐照技术、疑难血型鉴定、疑难配血技术、产前血液免疫学检查、新生儿溶血病检查等。通过先进的计算机及互联网技术，输血科开发出了输血科信息管理系统，实现了安全输血的信息化、规范化、准确化管理。
