南京市儿科研究所隶属于南京市儿童医院，基本构成主要为基因实验室、流式细胞实验室、病毒实验室、遗传实验室、中心实验室。现有专职人员8人，其中管理人员１人，研究生学历4人。

　　本所拥有万级细胞培养洁净实验室、基因扩增检验实验室、多台荧光定量PCR测定仪、流式细胞仪、染色体分析系统、全自动酶标仪、凝胶图像分析系统、荧光倒置显微镜、深低温冰箱等实验仪器设备，可以开展细胞学、分子生物学、遗传学等相关临床检测和课题实验。目前不仅可以基本满足本院研究生课题和立项课题开展科研实验工作的需求，同时还接受外单位研究生和科研人员在本所开展相关实验工作。

　　目前研究所常规开展的临床检测包括感染性疾病病原学检测、维生素Ｄ检测、外周血染色体分析诊断染色体异常遗传性疾病、淋巴细胞亚群分析（细胞免疫）、白血病免疫学及遗传学分型等。其中病原学检测技术处于全省领先水平，主要技术方法包括直接荧光法检测多种病毒抗原、荧光定量PCR方法检测病原核酸、ELISA方法检测病原抗体以及降钙素原检测等。并与中山大学达安基因股份有限公司（卫生部医药生物工程技术研究中心）共同建立了儿童感染性疾病实验诊断基地和儿童疾病分子诊断技术研究基地。

　　近几年来研究所主要工作内容包括软硬件建设、科研服务、临床检验、研究生培养、医学信息服务等，已逐渐成为院科研、医疗、教学的重要基地。并多次获得江苏省卫生厅新技术引进奖。
 
科室主任：胡正（副所长）
专家介绍：  胡正 主任医师、儿科研究所副所长
   从事小儿内科临床诊治工作二十余年，尤其在小儿神经内科和心理行为疾病诊疗方面具有较高的理论水平和丰富的临床经验。