妇科的前身是苏北地区妇幼保健院,建于1950年,现有主任医师4名、副主任医师16名。科室拥有全套妇科内窥镜、阴道B超、Leep刀等诊疗仪器设备。除开设普通妇科门诊外,还设有生殖内分泌、肿瘤、不孕不育、、宫颈疾病、性病诊治等专科特色门诊。2001年医院成立了妇科内窥镜中心,2002年成为扬州市重点专科。临床上除全面开展妇产科疑难杂症手术外,还开展瘤体缩减术,结肠代阴道术,腹腔镜下妇科恶性肿瘤根治术、子宫多发肌瘤剔除术、卵巢肿瘤切除术,宫腔镜下赘生物及粘膜下肌瘤切除术,广泛性全子宫切除术及盆腔淋巴清扫术,月经过多去内膜治疗,输卵管阻塞插管治疗和输卵管造口术,人工授精等先进医疗技术。