药学专科中心于1979年组建，原为海军411医院药剂科海洋药物研究室。1983年列编为海军药学专科中心。1995年评为海军专科中心，2005年12月通过南京军区医学专科中心的评审。2000年因科研工作成果显著，被《中国药学年鉴》载入药学研究机构专栏。该中心曾编著国家首部海洋药物专著《中国药用海洋生物》。成立以来共获得军队科技进步二等奖3项，三等奖22项，四等奖4项，国家发明专利3项，完成国家自然基金课题1项，在国内外发表论文180余篇。
该中心目前人员12名，聘任技术顾问3名，其中主任药师4名，副主任药师2名，平均年龄38.35岁。1999年来中心共承担全军、海军、上海市各类立项课题10项，获科研经费总计金额120.25万。指导培养博士3名，硕士研究生3名，指导第二军医大学、中国药科大学、江西中医学院本科毕业实习学生40余名。
