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小儿肿瘤外科前身与普外科同为一个科室，始建于60年代初期，于2001年独立建科。是目前浙江省内唯一单独成科诊治各类实体肿瘤的治疗中心，几十年来已积累了丰富的临床经验。小儿肿瘤外科与血液肿瘤科合作，采用国际先进诊疗模式，专诊治各种小儿良性、恶性肿瘤，如肾母细胞瘤、神经母细胞瘤、横纹肌肉瘤、肝母细胞瘤、骶尾部畸胎瘤、胃肠道肿瘤、卵巢肿瘤、血管瘤、淋巴瘤等。并应用数字剪影造影(DSA)、微量神经母细胞瘤细胞流式细胞仪检测等国际先进技术。在国内领先开展肿瘤的介入治疗法和腹腔热灌注化疗等新疗法，使许多晚期恶性肿瘤患儿得以治愈，尤其是晚期肾母细胞瘤的治愈率已经达到国内外先进水平。
肿瘤外科设有门诊，现与泌尿外科同为一个病区。病区现有医师11名，其中：主任医师1名、副主任医师4名，主治医生3名、住院医生3名。其中博士2名，硕士2名，在读硕士3名。拥有床位45张，并配备13名专业护士，50%的护士具有中级职称，有丰富的外科术后护理知识和扎实的护理技术，病区采用整体护理模式，为患儿术后康复提供人性化的护理服务。
