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感染性疾病科是集医疗、教学、科研、预防保健为一体的皖南地区最大的感染性疾病治疗专科, 现为安徽省临床医学特色专科和国家临床药品试验基地。
科室现有医护人员30人，医师15名，主任医师2人，副主任医师5人，主治医师3人，住院医师5人，具有博士学位1人、硕士学位3人。
设有发热门诊、肠道门诊(24小时接诊)、肝病、传染病专家及普通门诊，设病床76张，收治包括病毒性肝炎、结核病、感染性腹泻在内的30余种法定传染病及中枢感染性疾病、原因未明的发热性疾病。
感染性疾病科还积极参与主持皖南及芜湖地区突发性公共卫生事件的处理工作;承担皖南地区感染性疾病科急危重病、疑难病的会诊工作，在新发传染病诊治方面处于国内先进水平。
作为临床教学医院，科室还承担着临床科研与皖南医学院《传染病学》的教学任务。
