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医院开业之初输血科(血库)设立于检验科。按照三甲医院要求，2009年9月血库从检验科中分离出来，成为完全独立的输血科，由陆应玉担任输血科主任。输血科现有工作人员6人，均是经过输血专业理论和实验技术培训合格的医学检验人员。近年来输血理念不断更新，大力推广成分输血。
随着医院用血量的逐月递增(目前仅次于安医大一附院及安徽省立医院)，输血科向临床提供24小时服务，满足临床用血需求，为临床提供红细胞悬液、洗涤红细胞、机采及手工血小板、冷沉淀、新鲜冰冻血浆等不同的血液品种。
输血科目前开展的服务项目有：ABO血型及Rh血型检测、不规则抗体筛选和效价测定、交叉配血等输血前常规检查，疑难血型的鉴定，疑难配血，新生儿溶血产前实验室诊断等。科室已引入抗人球微柱凝胶技术，并建立了输血信息化管理系统，保证了常规用血安全及稀有血型和疑难病例的安全输血。
输血科牢固树立“质量就是生命”的意识，健全科室质量管理工作制度，全方位加强质量和学科建设。为临床提供安全、及时、有效的服务。
