武警浙江总队医院胸心外科是医院的传统优势学科，位于住院二部三楼，共开展床位65张。拥有医护人员24人，其中医生9人，护士15人。主要包括普胸、心胸两大专业。该科本着“发扬传统、团结协作、精益求精、不断超越”的建科理念，做到“人无我有，人有我精”。2005年被嘉兴市卫生局命名为“嘉兴市首批医学重点学科”。

　　该科开展肺部手术近60年，为国内最早开展肺外科手术单位之一。在各类胸部疾病的诊疗上与国内先进水平保持同步，特别是在肺癌、食管癌以手术为主的综合治疗方面，全部采用规范的国际标准，严格按TNM分期，对患者进行个性化治疗，使患者的3年及5年生存率达到国内先进水平。同时，该科还开展了先进的胸腔镜技术成功运用于气胸肺大泡切除或肺大泡结扎、肺修补术，脓胸纤维板剥脱术，肺部分切除术、肺叶切除、手汗症治疗、漏斗胸矫治、血胸止血、连枷胸固定等；纵隔镜技术成功运用于纵隔肿瘤切除、淋巴结活检及肺癌淋巴结分期。心外科能开展成人或小儿的房间隔缺损、室间隔缺损、法乐氏四联症、动脉导管未闭、三尖瓣下移畸形、名种瓣膜病、心包疾病、胸内大血管病变、冠状动脉搭桥术，室壁瘤切除等种类的心脏病手术。