我院2002年初率先在疆内组建内镜中心，将原先分布于各科的内镜集中管理，内镜中心集中了胃镜、肠镜、小肠镜、十二指肠镜、支气管镜、喉镜、膀胱镜、胆道镜等八种内镜，仪器设备先进，居疆内一流，处于领先水平。配置有先进的各类内镜主机、各种电子内镜、氩气刀、高频电发生器等治疗设备、操作治疗室，先进的无痛内镜复苏室、内镜清洗消毒室等。

　　内镜中心由拥有丰富临床经验及内镜诊疗技术的高级职称医师开展内镜下诊治。消化科医师负责消化内镜(胃镜、肠镜、小肠镜、十二指肠镜)的诊治，呼吸科医师负责支气管镜的诊治、耳鼻喉科医师负责喉镜的诊治、泌尿科医师负责膀胱镜的诊治、肝胆外科医师负责胆道镜的诊治，(详细资料见各相关科室网站资料)。操作医师执行严格的内镜操作准入制度，每年内镜检查治疗人数约15000余人次。能进行目前国内开展的多数的内镜方面的检查和治疗，检查病例数位居全市三甲医院前列。

　　内镜中心下属于医院直接领导。各类内镜集中管理，资源共享，严格控制院内感染，仪器设备专人管理，统一调配，建立了一整套严格的规章制度，层级管理，责任到人，严抓质量管理，设立了专门的护理单元，坚持为病人提供人性化的服务，实现了患者从就诊到检查治疗的一体化服务流程，拓展了服务范围，提高了服务质量。

　　近年在卫生部“医院质量管理年”检查活动中，内镜中心得到专家组高度认可，在反馈大会上特别提出表扬，膀胱镜室2007年被评为卫生部内镜培训基地，取得了可喜的成绩。