福州总医院儿科是全军儿科中心。现有专业技术人员32名，其中高级职务6名，中级职务4名；博士5名、硕士4名；设有病房、实验室、阅览室和新生儿重症抢救室；配有呼吸机、床边血液净化机、过敏原监测仪、经皮胆红质测定仪、远红外线抢救台、电子保暖箱、蓝光治疗箱、微量血糖仪等医疗设备及冷冻离心机、自动照相显微镜、PCR仪等实验室设备。拥有58张床位，是目前福建省综合性医院儿科中床位最多科室之一。由于科室技术力量雄厚，服务质量高，并有医院综合实力为后盾，获得省内同行及病儿家长的信任。每年收治住院病儿2300~2500名，其中不少为省内、市内医院转送的危重、疑难病儿。中心科研工作硕果累累，近5年先后在核心期刊发表论文285篇，获军队科技进步奖二等奖3项，三等奖26项。2003年获福建省科技进步二等奖2项；2004年获福建省科技进步三等奖2项。主编专著5部，参编9部。
 
    1991年3月组建南京军区儿科专科中心。
    1997年10月组建南京军区儿科研究所。
    2000年9月经总后卫生部批准为全军儿科中心。
    1993年10月，通过国家卫生部、联合国儿童基金会、世界卫生组织检查，批准为全军首批爱婴医院。
    1998年12月，经总后卫生部批准，组建全军计划生育优生优育中心。
    2003年10月，经总后卫生部批准，组建全军计划生育优生优育研究所。
    1991年5月经总后卫生部考核批准为第一军医大学联合培养硕士研究生，儿科学专业点。2001年批准为博士研究生点。
    2004年经军区批准为南京军区福州总院博士后工作站儿科点及博士后导师。