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胸外二科源于本院胸外科，成立于1979年，经过多年建设形成了在肿瘤胸外科领域完善的医疗、科研医师培养和行政管理体系，目前科室由医生8人，护士12人，其中主任医师2人，副主任医师2人，主管护士4人，在美国攻读博士学位1人，曾先后于日本庆应大学及九州国立癌中心进修2人。
科室目前主要开展三项临床和基础研究：NEW YORK UNIVERSITY和中国医科大学联合的关于非吸烟女性肺癌的病因学研究：与日本国立癌中心合作的温热低渗顺铂治疗癌性胸膜炎的临床研究；与中国医科大学联合的差异显示法筛选小细胞肺癌转移基因的基础研究。以上三项在国内均属于领先水平。
本科室拥有完善的ICU设备及人员配备，PENTAX纤维支气管镜1台，BIRDVS02型呼吸机1台，HP多功能监护仪4台，除颤器1台，食管扩张器1套，B超机1台，KENZ106型心电图机1台，贝朗微量输液泵2台。
