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该科现有医师8名（硕士研究生3名），其中副主任医师1名，主治医师2名，住院医师5人；专职护士9名。拥有泉州市第一个大型内镜清洗消毒管理中心及内镜储存设备，设备最齐全规模最大检查及治疗项目最多。安吉院区内镜室面积1000㎡，目前已进入初步装修阶段，投入使用后将全面开展无痛性内镜检查。
每年完成胃肠镜及十二指肠镜检查达15000人次。除常规开展胃、肠、胆、胰等检查外，还开展息肉、腺瘤、肿物切除术，食管狭窄、食管异物、食管瘘、食管胃底静脉曲张套扎、硬化剂及组织粘和剂注射，胃内异物取出术、碎石术、胃肠造瘘术，消化道出血注射止血、钛夹钳夹无创检查幽门螺杆菌检查（14C呼气试验）等，开展部分无痛性内镜检查。开展结肠、直肠狭窄支架置入术，对患者肠梗阻症状有很好的改善效果（详见医疗特色栏）。
