内蒙古中蒙医院肛肠科创建于1962年，是自治区最早的中西医结合特色专科之一，被列为自治区级重点学科，下设肛肠一科和肛肠二科，开放床位80张，独立配备设施齐全的手术室、换药室，拥有电子纤维结肠镜、激光治疗仪、肛肠微波治疗仪等多种专科仪器设备，自制的痔科Ⅰ号、Ⅱ号洗剂效果显著，在全国尚属首创。
   
    该科学科建设坚持“立足专业、服务于民、疗效第一”的宗旨，坚持结、直肠疾病与肛门部疾病相结合、良性疾病与恶性疾病相结合、诊断与治疗相结合、临床与科研相结合的指导方针，逐渐形成了自己的特色和优势。
   
    科室开展的主要项目有：药物法、注射术治疗各类混合痔。手术治疗环行混合痔、复杂性肛瘘、婴幼儿肛瘘、各期肛裂、肛周脓肿、直、结肠肿瘤，息肉、直肠肛门狭窄、骶尾部肿瘤和窦、直肠脱垂、肛门失禁以及先天性肛门闭锁、畸形、巨结肠、结肠冗肠症、肛周皮肤病等疾病；顽固性便秘手术、直肠前突修补术、耻直肌全束部分切断术、肛门瘙痒症的注射术及皮肤切除术和皮下神经切断术，其中，切开肛瘘挂线对口引流法治疗复杂性肛瘘和肛周脓肿，一次治愈率高，处于国内领先水平。中、蒙、西医结合治疗急，慢性溃疡性大肠炎、顽固性便秘、结肠急惹综合症、克隆氏病等疾病；率先在内蒙地区开展PPH术，重度肛门狭窄的“Y—V”成形术，会阴体缺如合并完全性肛门失禁修复术等难度较高的手术。大大减轻了患者的痛苦，填补了自治区在这一领域的空白。同时，科室运用电子纤维结肠镜，双螺旋CT、腔内B超等先进设备，开展了排粪造影、大肠传输试验、肛管压力检测等新的检查项目，对肠道良、恶性肿瘤、息肉、肠炎、顽固性便秘、复杂性肛瘘等疾病进行诊治，疗效显著。一些配方独特、疗效稳定的专科制剂，如：“痔科I、  Ⅱ、Ⅲ号洗剂”，“黄连膏、消肿膏、生肌膏、红升膏、红粉纱条”等十余种制剂的临床运用，尤其在术后换药中的使用，大大缩短了患者的住院时间，减轻了术后疼痛，受到了患者的好评和同行的认可。 
   
    科室在业务量大幅度提升的同时，也注重科研、教学的发展，现承担的“环行混合痔外剥、内荷包术的临床观察”为自治区卫生厅资助的I类课题，每年在各级学术期刊发表专业论文十余篇，每年接受区内各级医院进修人员20余名，为自治区肛肠诊治水平的整体提高作出了一定贡献。
   
    该科始终坚持“以病人为中心，以教学为重点，以质量为基础，以服务为宗旨”的办科方针服务于社会，在内蒙古自治区及华北地区乃至蒙古国皆享有一定声誉。