南京市第一医院药剂科由药库、门诊药房、门诊草药房、急诊药房、中心药房、南院门诊药房、南院中心药房、鑫园门诊部药房等部门组成，承担全院医疗、科研用药和试剂的采购供应、临床药学等医院药学服务，同时承担医院药事管理委员会的日常工作，协助进行医院相关药事管理工作。目前全科共有员工70余人，其中高级职称5人，中级职称20余人，初级职称40余人及药品会计等少量辅助人员。药剂科的目标定位是以标准化供应管理药品、以优良药学专业服务为目的调剂药品、以合理用药为核心结合教学、研究和专职临床药师为一体的医院药学综合学科。
