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病理科于1998年8月被军区卫生部确认为军区病理科重点专业。科室设有病理诊断室、细胞学实验室、技术室、仪器室、标本送检室、取材室、档案资料室等。拥有北航全数码图像分析系统、QP-B型切片漂片温控仪、BM-Ⅱ型病理组织包埋机等先进设备。
近年来，在病理学研究和病理新技术方面不断发展。参加湖南省和衡阳市病理读片会，总计达50余次，读片结果与出片单位的意见有很高的符合率，得到与会专家的高度评价。尸检病理诊断正确率达100%，2003年2月被衡阳市卫生局授予法定尸检机构。快速冰切片与常规切片诊断符合率达95%以上。同时进行了免疫组化的规范化及常规化工作，目前常规抗体已达到50余种。
病理科自建立以来，共发表学术论文10余篇，参加汇编《战伤病理学》一书。获军队科研成果二等奖一项、四等奖二项、五等奖2项。
