呼吸内一科为济宁市、济宁医学院重点学科、北京呼吸病研究所的协作单位。姜鲁宁主任医师为呼吸内一科学术带头人。本科先后承担山东卫生厅及省教委科研课题3项,承担济宁市科委课题15项,并与北京呼吸病研究所共同承担国家十五攻关课题“肺动脉栓塞的防治研究”。在鲁西南率先开展气道反应性测定诊断不典型哮喘、胸腔镜诊治胸膜疾病,经肺导管治疗难治性肺感染,无创通气治疗呼吸衰竭及睡眠呼吸暂停综合征(鼾症)、肺肿瘤化疗及肺动脉介入化疗。在机械通气救治呼吸衰竭方面积累了丰富经验,经胸腔镜局部用药治疗难治性良性胸膜疾病的研究达到国内领先水平,获济宁市科技进步二等奖。科研项目氨基胍对哮喘大鼠呼吸力学影响获山东省科委科技进步三等奖,近年来全科共发表学术论文近50篇。