呼吸科成立于1986年，2005年被确定为市级重点专科。该科拥有进口呼吸机、无创通气机、肺功能仪、纤维支气管镜、多导睡眠仪和电脑气胸仪等一批先进设备，在市内同级医院中较早开展了纤维支气管镜诊疗及机械通气技术，引进并独立开展了经纤维支气管镜活检，经皮肺活检，纤维支气管镜下支气管造影、良性肿瘤摘除及异物取出，气道记忆合金支架植入治疗气管狭窄、机械通气及无创通气抢救呼吸衰竭等一批新技术、新项目，每年成功抢救危重病人60多人次，处市内同级医院领先水平；2001年在苏北地区首家引进多导睡眠仪，成立睡眠呼吸障碍疾病诊疗中心，成功开展睡眠呼吸障碍疾病的诊断与治疗，填补了市内空白。
