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重庆医科大学附属第一医院消化内科是重庆市重点学科，是博士、硕士学位授予点，现有博士导师2名，硕士生导师4名，教授2名，副教授6名，主治医师6名，医师中有2名获得博士学位，6名具有硕士学位。
消化内科在全市率先使用胃镜诊断胃溃疡、胃癌、胃炎等疾病，近年又引进国际上最先进的电子胃镜，使诊断准确率大大提高。在西南地区率先开展十二指肠镜乳头切开取石术，达到国内领先水平。通过胃镜、十二肠镜使胃息肉、胆管结石等患者避免了手术之苦，也解决食管癌不能进食的棘手问题，使失去手术机会的胃癌患者延长生命，提高了消化道出血的止血水平。
该科对胃、十二指肠溃疡的治疗达到国际先进水平。在全国最先应用新型药物治疗胃、十二指肠溃疡。为减少消化性溃疡的复发，在全国最早开始幽门螺旋杆菌的研究工作，该项科研成果目前广泛用于临床，进一步提高了消化性溃疡的诊治水平。
通过与国外著名大学医院合作，对胰腺、肠道疾病作了大量基础研究，现对急性慢性胰腺炎的诊治处于国内领先水平，获各级科研成果奖多项。该科治疗慢性肝炎、肝硬化、肝衰竭也有独道之处。
