市三医院心理卫生医学体系现有9个亚专业科室，其中少儿心理卫生科和心身疾病科为省级重点学科。负责牵头全省精神卫生的医、教、研、防工作。现有医学博士2名，主任医师5名，副主任医师13名。其中有省医学会精神科专委会副主任委员、省心理卫生协会副主任委员、省行为医学会理事、省精神康复专委会副主任和委员多人。主办有国内外公开发行的《四川精神卫生》杂志。该专业主要提供各种精神疾病的治疗服务，为各类人群提供心理咨询服务，并开展各类精神障碍的临床研究和治疗工作。该专业所开展的精神疾病中西医结合治疗、电针脉冲治疗、现代ECT和生物反馈治疗技术享誉国内外。与日本、美国相关机构建立了长期友好合作关系。
