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上海市中医医院肺病科于1999年在原内科基础上独立分科。现设有病床20张，年收治住院病人总数：400余人次；床位使用率：95%以上；年门诊量：1万余人次。
科室突出传统中医药治疗特色，以中药治疗、冬病夏治（穴位敷贴、穴位注射等）及冬令膏方治疗慢性咳喘病为特色。
采用中西医结合方法治疗各种呼吸系统疾病。主治疾病包括：急慢性支气管炎、阻塞性肺气肿、肺心病、支气管哮喘、支气管扩张、咳血、肺炎、呼吸衰竭、间质性肺疾病、肺癌、胸腔积液等。对危重疑难病例，科室重视现代医学诊疗技术的运用，配有呼吸机、支气管镜、床边心电监护机、64排CT和中心实验室等，能满足呼吸系统疾病的诊治需要。
目前科内有医生6名，其中主任医师1名，副主任医师2名，主治医师1名，住院医师2名，硕士生5名，博士生1名。科室承担了上海市卫生局课题、上海申康医院发展中心课题、国家“十一五”科技支撑计划课题等各级别科研课题。还承担了上海中医药大学的中医内科、西医内科呼吸系统的部分教学任务，并指导本科生、进修医师临床实习。呼吸内科医生医疗技术熟练，基本功扎实，竭诚为广大患者服务。
