华西医院肿瘤中心的前身为华西医科大学附属第一医院肿瘤科，建科于1960年，是西南地区最早开始肿瘤专科治疗的科室。经过40多年的不断发展，现已成为西南地区规模最大，国内一流的肿瘤治疗中心。，肿瘤中心原包括化疗、放疗、生物治疗三个科室。2007年以后，根据以病人为中心的原则进行了学科重组，按病种重新组合为腹部肿瘤科、胸部肿瘤科和头颈乳腺肿瘤科三个科室和一个放射物理技术中心。
   
    华西医院腹部肿瘤科集合了原化疗、放疗、生物治疗和介入治疗科的优秀人才。现有医护人员80余名，其中教授5名、副教授6名、主治医师5名、住院医师及肿瘤专业研究生30多名、护理人员40名。主病区位于第三住院大楼7楼全层，病床140张，另有肿瘤综合病房、日间病房机动床位数十张。科室主治医师以上人员均为肿瘤学专业博士或硕士毕业，拥有长期的临床实践经验并且每年至少有1－2次到国外发达国家参加临床学术交流会议，获取最新医疗信息，保证了科室医疗技术在国内外的先进性。
         
    集中多学科优秀人才，开展个体化综合治疗是我科的鲜明特色之一。运用化疗、放疗、热疗、分子靶向治疗、免疫生物治疗、介入治疗和中医药治疗有机结合的综合治疗模式，开展了一系列我科特有的、国内先进的新型肿瘤内科治疗。科室对每一位新入院的病人均经过严格的多学科讨论来制定个体化的综合治疗方案。在全国形成以了以个体化的综合治疗为突出特色腹部肿瘤治疗学科。不断有来自北京、上海、广州、南京等地大型医院的肿瘤学专家和学科带头人来我科参观学习。在数十年的发展中，我科老、中、青专家在始终坚持与国际接轨的同时，在治疗策略、方法和模式上不断创新，使恶性肿瘤内科治疗的治愈率和有效率均达到国际先进水平。

    此外，我科是国家指定的抗肿瘤新药临床试验基地，已承担和完成了30余项国内外新药临床试验（包括在肿瘤治疗领域具有重大意义的紫杉醇、多西紫杉醇、健择、希罗达等新药的国际多中心临床试验），目前正在进行多项国际最新的抗肿瘤药物临床试验；还与慈善机构及大型跨国企业合作进行不定期的和有选择的赠药活动。因此，我科住院病人完全可能获得与欧美发达国家一致的最新的抗肿瘤治疗。
位于高新区华西科技园的《肿瘤分子靶向治疗研究室》为我科的实验研究基地。我科人员在其中承担有国家杰出青年科学基金、国家973重大科研项目以及多项国家自然科学基金和省部级科研基金。研究室与美英等国的多个一流的实验室建立了合作关系，常年对外招收从事肿瘤临床和应用基础研究的博士、硕士和博士后科研人员。