武警福建总队医院神经外科以立体定向技术、介入技术、微创技术、显微技术为特色，全面开展神经外科多种疾病的诊断与治疗。神经外科是医院重点发展科室之一，开设床位40余张。拥有高级职称医师3人，中级职称医师5人，博士后，博士，硕士各一人，省内首家引进美国“细胞刀”系统、瑞典ELEKTA射频仪、德国BRAINLAB手术计划系统128无线蓝牙术前定位系统、脑皮层表面电极及深部电极等术中定位治疗系统、现代立体定向导航系统、进口徕卡手术显微镜、高精度立体定向仪、呼吸机、麻醉机、整套德国蛇牌手术显微器械等进口的先进高科技等设备。是省内最大的功能性神经外科中心。开展的立体定向手术属于微侵袭神经外科，具有高精度、 微创伤、见效快、反应轻、安全性高、并发症少、 复发率低等优点，是目前国际上最为推崇的微侵袭 治疗技术。在治疗精神类疾病、癫痫、帕金森及三叉神经痛等疾病方面疗效显著。近期与干细胞研究中心合作共同开展了帕金森及脑中风及脑外伤后遗症的干细胞治疗。是我国较早开展干细胞治疗的临床机构之一。
