胸外科是我省最早开展胸腔手术的老牌单位，该科技术力量雄厚、科研能力强和现代医疗设备先进，是省内普胸微创外科重要的培训基地，也是福建省胸腔镜外科学组和福建医科大学手汗症研究室的挂靠单位。现有主任医师（含教授、博导）1名，副主任医师3名（含副教授），博士3名，硕士3名。涂远荣教授是国内胸外科知名专家，是全省胸外科学术带头人。台湾长庚医院刘会平教授和日本东京琦玉大学中山光男教授为该科客座教授。
该科在诊疗胸部肿瘤及胸腔疑难杂症方面具有丰富的临床经验，除完成700余台/年大型手术外，还指导全省各级医院的抢救和手术等工作。近10年开展胸部微创胸腔镜手术2000多例（省内首位），其中全腔镜下肺癌切除、胸腺切除、肺气肿、漏斗胸、胸腔积液、手汗症等疗效均达国内先进水平。
近年来承担省、厅级多项科研课题，举办过国家级胸部微创手术学习班，“胸腔镜肺减容术治疗重度肺气肿”获福建省科学技术三等奖，出版首部国内外手汗症专著《手汗症现代微创治疗》。
