小儿外科为我院重点学科现有医护人员32人高级职称5人中级职称10人其中博士后及博士各1人硕士3人四川省卫生厅学术技术带头人后备人选1名,成都市第一批学术技术带头人1名重庆医科大学兼职硕士导师1名我科设有各亚专业可以开展小儿各种类型手术

新生儿专业可以开展各种先天性手术；泌尿外科开展的圈套法包皮环切术术中不出血术后并发症少外形美观得到患儿欢迎隐匿性阴茎和尿道下裂是该专业常规开展的先天性泌尿系统畸形手术为许多患儿解决了难题

已有20余年历史的血管瘤专科在西南地区有较大影响累计治疗4万余例小儿矫形外科对髋关节脱位马蹄内翻足等先天性疾病开展的手术治疗及术后康复治疗有很好的效果；小儿普外对先天性巨结肠先天性胆总管囊性扩张症等腹部疾病的诊治水平处于省内先进地位小儿心胸外科对心脏大血管肺及纵隔各种疾病均可开展手术治疗
 
小儿神经外科是我省唯一的小儿神经外科专业对脑脊膜膨出脑积水和颅内肿瘤都可以进行手术治疗我院小儿腹腔镜手术技术处于四川领先地位由于创伤小术后几乎无疤痕得到很多家长的赞扬

最具特色的亚专业是小儿肿瘤专业我科应用介入技术手术和化疗相结合的综合治疗技术达到了国际水平治愈了许多难治性肿瘤疾患多篇学术论文在国内外杂志发表为严重的小儿实体性肿瘤患儿带来了希望

近年来我科承担了民政部组织实施的“残疾孤儿手术康复明天计划”及中国“残联”组织实施的“贫困肢残儿童手术康复项目”已为近400名残疾患儿进行了手术康复得到了社会各界的广泛好评

近两年开展新技术20余项其中小儿外周血管DSA检查肿瘤介入治疗技术经肛门巨结肠根治术等达到国内先进水平