惠州中医院外二科是以微创外科为主。位于住院部三楼，环境幽雅，空气清新，设有病床 25 张，有副主任医师 3 名，主治医师 2 名，住院医师 2 名。主要开展业务：泌尿外科、肝胆外科、颅脑外科。微创外科手术特点：损伤小，恢复快。其中泌尿外科开展：经皮肾穿刺取石术、输尿管弹道碎石取石术等泌尿系结石微创治疗、经尿道前列腺电切术、经尿道膀胱肿瘤切除、输尿管内支架置入术等微创手术、并开展腹腔镜肾癌根治术、肾囊肿切除术、先天性尿道下裂成形术、阴茎下区矫形术、肾上腺瘤切除术；腹腔镜手术，开展了腹腔镜胆囊切除、肝囊肿开窗除术、腹腔镜下胆总管切开取石术、腹腔镜下阑尾切除术、腹腔镜下胃肠穿孔修补术；颅脑外科开展 CT 定位微创钻颅血肿清除术、脑室腹腔分流术。 CT 定位微创钻颅血肿清除术治疗高血压脑出血，定位准确，手术时间少，创伤小，术后中西医结合康复治疗，疗效显著。
