医学工程科负责全院医疗设备的安装、调试、维修、保养、及仪器革新和设备引进的评估及报废的鉴定、全院医用消耗品的请领发放和灭菌消毒和部分医疗器具的医学计量检定工作。设有维修室、器材库、供应室三个部门。
医学工程科重视工作人员的技术培养。科室在医院购置大型医疗设备时选派工程技术人员参加维修技术培训，掌握其工作原理、日常维护及保养知识；定期组织学习学科发展新动态、新技术；不定期选派工程技术人员学习国家和军队设备管理的法规、操作规程等。
维修室担负全院1.5亿多设备的维修、维护，主要负责全院医疗设备的计划、论证、验收、管理、维修和维护保养以及报废，为临床科室仪器设备的正常运转起到保驾护航作用。设有全军医学仪器三级计量站，负责每年对全院部分必须强检的医疗仪器进行计量检定工作。设备档案由专人负责管理，采用现代自动化管理方式，保存并记录设备的采购过程和安装验收情况等基本信息。
器材库负责全院各种医用耗材的计划、采购、供应和仓库内各类医用耗材的请领和发放等工作，负责器材仓库的各种日常管理，为临床科室的日常工作起到奠基作用。
消毒供应室负责各科室医用物品的消毒和发放，保证临床科室医用物品的需求。在医院新医疗楼内投入600多万元安装了瑞士BELIMED 公司生产的高压消毒柜、手术器械清洗机、环氧乙烷消毒柜、床垫消毒柜等大型设备。
