输血科是一个集医疗、教学、科研为一体的科室,前身是检验科的血库，早期实行血液自采自供，后来，实行由自贡市中心血站统一供血，经过了由全血到成分用血、科学、合理、有效输血等成长过程。由于医院的发展、壮大，医院经过二甲、三乙、三甲的发展，于2004年成立输血科，2009年7月，输血科与检验科分离，独立成为一级科室。
       
    输血科现有专业技术人员6人，其中，高级职称1人，中级职称1人，初级职称4人。专业技术力量较为雄厚，学科整体已达川南地区综合医院输血科先进水平。承担着医学中心的医疗，教学，科研任务，开展了ABO血型鉴定，Rh(D)血型鉴定，不完全抗体的筛查、输血相容性检测，Coomb’s试验；血型抗体效价测定等实验项目，开展了新生儿溶血病检测、最先进的卡式交叉配血、成分输血、自体输血、血浆置换、新生儿换血治疗、去白细胞血输注等相关项目，同时，也开展输血相关疾病的治疗咨询。
       
    输血科年用血量200万毫升左右，基本满足临床需要。已获得自贡市卫生局新技术引进奖励三等奖三项，承担的教学任务包括卫校的中专生、专科生的教学任务，来院实习的中专生、专科生、本科生、进修生的实习教学任务，本院专科医师培训任务，全院临床医师科学、合理、有效输血的相关培训。