福建医科医科大学附属第一医院胃肠外科二区是在原肿瘤外科胃肠专业组的基础上成立的，是一个集临床、科研、教学于一体的胃肠道专科，实力雄厚，其技术力量居省内领先水平。拥有主任医师三名，副主任医师一名，高年资主治医师四名，其中享受国务院特殊津贴专家1名，教授一名，副教授三名，硕士研究生导师4名，具有博士学历3名，硕士学历3名。
胃肠外科二区主要致力于胃肠道疾病的外科诊治及基础临床研究，尤其在胃肠道肿瘤诊断与治疗方面更具专业化，每年完成数百台胃肠道肿瘤规范化手术如胃癌联合脏器切除术、保留盆腔植物神经的全直肠系膜切除、直肠癌超低位切除吻合术、经腹腔镜胃癌、结直肠癌根治术、家族性腺瘤息肉病的现代手术治疗、严重痔疮及直肠脱垂的手术治疗。另外还开展了腹部创伤及急腹症等常见病的规范诊疗工作。在省级以上医学杂志发表专业学术论文100余篇，培养了30余名硕士研究生，获省、厅级医药卫生科技进步二等奖一项、三等奖三项，主持多项省自然基金资助的科研课题和省教委、卫生厅资助的科研课题。
