传染病医院眼科承担了普通门诊患者的诊断和治疗工作，擅长于白内障、青光眼眼外伤尤其眼化学伤、翼状胬肉的显微手术治疗和眼底病的诊疗、如老年性黄斑变性、糖尿病视网膜病变、视网膜静脉阻塞等。    上海市（复旦大学附属）公共卫生临床中心为了进一步发展业务的需要，于2006年4月建立眼科，现有高年资主治医师、高年资住院医师各一名，硕士一名，在读硕士一名，并配备眼科专科护士。本科室工作人员具有较坚实的眼科学知识和丰富的临床经验，工作认真负责，工作作风严谨，行医廉洁。

    眼科承担了普通门诊患者的诊断和治疗工作，擅长于白内障、青光眼、眼外伤尤其眼化学伤、翼状胬肉的显微手术治疗和眼底病的诊疗，如老年性黄斑变性、糖尿病视网膜病变、视网膜静脉阻塞等。此外，对艾滋病、结核等感染性疾病相关眼病有特别的研究，完成并发表论文10余篇及专著2部；目前承担和参与四项科研课题。依托中心资源和科研优势，眼科将建设成为集临床、科研、教学为一体的眼科特色专科及艾滋病相关眼病研究及临床医疗中心。

    眼科拥有先进的眼科诊疗设备：HAAG-STREIT裂隙灯、全进口数码前节照相裂隙灯、进口显微镜、眼底荧光造影机、非接触眼压计、电脑验光仪、角膜曲率计、间接眼底镜、TOPCON眼底照相机及视野计，眼部A/B超等。

    眼科特色：艾滋病相关眼病、白内障、青光眼、眼表重建、眼外伤显微手术、眼底病的治疗、艾滋病相关眼病。

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