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湖南省妇幼保健院妇科分为妇一、妇二、妇三3个科室。妇一科原名生殖健康科，主要诊治各种生殖器官疑难性疾病，包括：生殖器官畸形、损伤性疾病(如子宫脱垂、外伤)、生殖器官肿瘤(包括子宫肌瘤、卵巢肿瘤等)、慢性炎症性疾病及不孕不育、生殖内分泌紊乱(如功能性子宫出血、闭经、月经紊乱)等。2004年底，被省卫生厅确立为“湖南省重点学科”。
妇二科拥有先进的妇科疾病检查、监测、治疗设备，开展了对女性生殖系统疾病、妇科肿瘤特别是恶性肿瘤、内分泌失调、子宫脱垂、子宫内膜异位症、异位妊娠及各种妇科疑难杂症的诊治，恶性肿瘤的手术及化疗居省内妇产科学术界领先水平，能顺利开展广泛子宫全切、盆腔淋巴清扫、阴式子宫全切、腹腔镜手术、阴道成形术等各类妇科手术。
妇三科担负着各种妇科疾病的诊治及研究工作。对女性生殖系统炎症、妇科肿瘤、性病、月经失调、子宫内膜异位症、异位妊娠、盆底功能障碍性疾病、内分泌失调及各种妇科疑难杂症的治疗水平居省内妇产科学术界领先水平。
